PHA生产的另一条可行的途径是利用转基因植物来实现。PHA在植物中的合成,可以利用光能消耗二氧化碳,成为一种可持续、可再生的材料生产方式。现在已在烟草、马铃薯、棉花、油菜、玉米、苜蓿等植物中实现了包括 PHB、PHBV以及中长链PHA等不同PHA的合成。而其中在马铃薯块根中的PHA合成是最具生产前景的。目前PHA的价格还很难和石油化工塑料相竞争,而聚丙稀的价格低于1美元/kg,而一些最便宜的生物可降解塑料的价格为3-6美元 /Kg,而当今理想的PHB的生产成本为4美元/kg,随着规模的扩大,生产成本将进一步降低,但很难达到2-3美元/kg,这主要是由于细菌发酵底物成本所决定。 但通过转基因植物的PHA合成,有望将PHA的成本大大降低,因为植物利用二氧化碳和太阳能生产植物油和淀粉的成本分别为0.5-1美元/kg和0.25美元/kg,另外植物中PHA的提取过程也有了较好的研究,提取成本不高于细菌中PHA的提取成本。PHA在植物中的生产将使经济作物的可再生资源使用大大地迈进,这个项目的成功可能使到2020年植物生产基本化学原料和材料中可更新资源的使用达到现在的5倍。