当然有影响。学校是根据你的专业志愿顺序把你招到相应的专业的。
平行志愿有先后顺序
1、平行志愿录取时，按照“分数优先，遵循志愿”的原则进行投档，对同一科类分数线上未被录取的考生按总分从高到低排序进行一次性投档，即所有考生排一个队列，高分者优先投档。
2、平行志愿虽然是平行的，但同样是有顺序的。有人片面认为平行志愿没有顺序，几所院校都一样，这是不对的。平行志愿的顺序是很重要的，录取时是按照考生自己填报的顺序依次进行检索。因此，一定要把最想去的院校放在最前面。
3、以往，考生和家长填报志愿时，“必修课”之一就是查询有意报考高校往年的录取情况：前一年分数线高了，当年报考的人会少一些，分数就会降低。这种非正常现象又直接影响到下一年度考生的志愿填报，于是频频出现“大、小年”的现象，造成恶性循环。
填报平行志愿的注意事项
首先，平行志愿是各个省市区的招生政策，与具体学校无关。就是说，大学是没有办法决定是不是实行平行志愿或是不是招收平行志愿的考生的。
如果一个省市区没有实行平行志愿，那么这个大学在这个省市区招生时就不能按照平行志愿招生。因此，一个大学在实行了平行志愿的省市区必须按照平行志愿招生，在没有实行平行志愿的省市区就只能按照传统方式招生。
其次，如果是以前的普通志愿报考方式，招生院校非常看重第一志愿，第一志愿是非常重要的。
平行志愿不等于各个志愿没有先后次序、没有第一志愿，但平行志愿与以前的志愿不同的是，只有考生和招生办知道你的志愿顺序，招生院校是不知道的，因此原来只招收第一志愿的大学就无从知道报考它的考生是第几志愿报考的它，因此是不是第一志愿就没有以前那么重要了。
从而，第一志愿还是很值得冒险的，但在这种情况下，第二志愿就应该与第一志愿有一定的级差，以防万一。为了确保录取，所有志愿最好都填满。
第三，平行志愿录取时，各个志愿对于录取学校有同等的效率，都相当于第一志愿。如果不够第一志愿学校的提档线，就看第二志愿学校的提档线，直到找到一个志愿的提档线不高于你的分数，就把档案放到这个学校。