二本医科学校排名前五的学校为湖北中医药大学、山西中医药大学、滨州医学院、南昌医学院、云南中医药大学。
1、湖北中医药大学
湖北中医药大，位于湖北省武汉市，是中国较早开办中医本科教育和最早开办中医研究生教育的湖北省高等中医药本科院校。
学校是教育部本科教学工作水平合格评估优秀学校，是湖北省人民政府、国家中医药管理局共建高校。入选国家“中西部高校基础能力建设工程”项目建设高校、湖北省“国内一流学科建设高校”、国家级中医临床研究基地“中医药防治肝病基地”。
2、山西中医药大学
山西中医药大学，主校区位于山西省晋中市，由山西省人民政府与国家中医药管理局共建。
为教育部首批卓越医生（中医）教育培养计划改革试点高校、山西省1331工程、推荐优秀应届本科毕业生免试攻读研究生高校、中医学专业“5+3”一体化招生院校、中国政府奖学金生委托培养高校、山西省深化创新创业教育改革示范高校，是山西省重点建设高校。
3、滨州医学院
滨州医学院，由滨州市人民政府与山东省教育厅共建。是山东省省属普通高等医学院校、山东省应用型人才培养特色名校。
滨州医学院有滨州、烟台两个校区，占地1718.17亩，总建筑面积90万平方米，教学科研仪器设备总值4.7亿元，图书馆藏书145.3万册；设有16个院（系），有35个本科专业（方向），7个硕士学位授权一级学科，40个硕士学位授权二级学科，9个硕士专业学位授权点。
4、南昌医学院
南昌医学院是由江西省人民政府举办、江西省卫生健康委员会行政主管、江西省教育厅业务指导，并经中华人民共和国教育部批准成立的独立设置的全日制普通本科高等医学院校。
院有湾里和小蓝两个校区，占地面积905.6亩，规划建设中的新校区占地面积1000余亩；有直属附属医院3个，直属附属机构1个；设有13个教学院部，开设15个本科专业。
5、云南中医药大学
云南中医药大，坐落于云南省昆明市，是云南省人民政府与国家中医药管理局共建高校，全国第二批成立的高等中医药本科院校，为云南省唯一一所中医药本科院校，入选国家中医药临床研究基地、国家教育信息化试点单位、云南省中医药国际教育基地。
学校设有11个学院、2个公共课教学部，直属附属医院2所，非直属附属医院13所，开设25个本科专业；拥有1个一级学科博士学位授权点，省级立项建设4个博士学位授权点，4个一级学科硕士学位授权点，5个硕士专业学位授权点。