首先需要获得mega
超级进化的手环，然后还要去入手超级进化的石头，并且身上有可以超级进化的精灵。
使用方法是要在背包里找到超级进化石，给对应的精灵带上，对战的时候派出携带超级进化石的精灵上场，在选择使用技能的时候先按开始键，再选择想要使用的技能，就可以完成超级进化了。
超级进化只在对战中有效，对战结束之后效果会消失。
mega超级进化是超越了目前为止宝可梦可进化的界限，属于更上一层的进化。进行了超级进化的宝可梦会暂时释放隐藏的力量，发挥无法透过一般进化拥有的能力。这种进化目前仅出现在特定的宝可梦身上。超级进化是一种暂时性的状态，不能永久保持。超级进化能够在第六世代和第七世代的游戏中使用。目前共有46只宝可梦可以进行超级进化。
超级进化后的宝可梦，种族值之和会增加，属性、特性都可能会有所改变。
在对战中要进行超级进化基本上有2个必要的条件。第1个条件是训练家身上带着的被称为钥石的特别道具，与宝可梦携带的对应超级石产生共鸣；第2个条件是宝可梦和训练家之间需存有深厚的牵绊。在
去吧皮卡丘去吧
伊布版本中，超级石不需要携带，
喷火龙和超梦可以自行选择超级进化的形态。主角与收服的所有宝可梦之间都存在深厚的牵绊，能够使自己的同行宝可梦进行超级进化。只有对应的宝可梦携带对应的超级石进入对战才能进行超级进化。与超级石不相对应的宝可梦，即使利用变身为对应宝可梦也不能进行超级进化。
烈空坐是目前唯一不需要超级石就能进行超级进化的宝可梦，只需学会画龙点睛后就能够超级进化，因此它是唯一可以携带其他物品的超级进化宝可梦。但是携带了属性Z纯晶的烈空坐不能进行超级进化。对战中NPC的可以进行超级进化的宝可梦在上场后会尽可能快地进行超级进化。