法律分析：1、新审批的宅基地。如果是新申请建造房屋，必须将老的房屋宅基地退还给村集体，否则新的宅基地是不能确权的。如果想给新宅基地确权，也要通过分户(父母与成年儿女分立户口)来确权；
2、修建在农村规划范围外的房屋。各个地方都有农村居住区的规划区域，农民建房要在规划的区域内，否则政府部门是不给确权的；
3、改变宅基地使用性质。农民申请的宅基地只能用来建造房屋，如果用作其他用途，不能确权；
4、买卖得来的宅基地。农民只拥有宅基地的使用权，买卖宅基地的行为不具备法律效力，所以，不能确权；
5、宅基地存在归属争议、手续不全。只有争议解决或补全手续后，政府才会给予确权；
6、非法占用的宅基地。我国法律规定，农村实行一户一宅的规定，一户一宅外多出的宅基地，除符合分户条件与合法继承的，是不予确权的。宅基地面积严重超标的，也是不予确权的。
7、违规占用农用地建设的房屋。此外，非法占有耕地建房的宅基地，这种更不会给确权，还有可能会被处罚，要求恢复耕地。
8、城市户口到农村建房；现在按照相关的规定，城市户口是不能到农村建房、买地等，现在农村宅基地已经是三权分立了，把使用权分离了出来，当然城市户口资本可以进行资金投资，但是买房、买地就不能，如果出现这样的情况将会被处罚或者直接拆除，想房屋确权就更加不要想了。
9、非村集体成员或者不合法建设；按照相关规定现在农村宅基地、房屋是不能与非村集体成员进行买卖的，如果特殊情况只能进行与村集体成员进行交换或者出售，还有另一种情况就是非法建设房屋，一般分为两种情况，一个是非法农业用地上建房，还有就是没有经过任何审批就私自建房，以上情况房屋都是不能进行相关的确权。
10、一个户口多个宅子；现在按照相关规定，一个户口只能确权一处房屋，拥有一户多宅的家庭除非特殊情况可以确权，比如：以前遗留下来或者继承的房屋，其它多余的房屋、宅基地如果是私自开垦建设没有合法程序，是不能进行确权工作。
法律依据：《中华人民共和国土地管理法》
第九条 城市市区的土地属于国家所有。
农村和城市郊区的土地，除由法律规定属于国家所有的以外，属于农民集体所有基地和自留地、自留山，属于农民集体所有。
第十条 国有土地和农民集体所有的土地，可以依法确定给单位或者个人使用。使用土地的单位和个人，有保护、管理和合理利用土地的义务。
第十一条 农民集体所有的土地依法属于村农民集体所有的，由村集体经济组织或者村民委员会经营、管理经分别属于村内两个以上农村集体经济组织的农民集体所有的，由村内各该农村集体经济组织或者村民小组经营、管理经属于乡(镇)农民集体所有的，由乡(镇)农村集体经济组织经营、管理。
第十二条 土地的所有权和使用权的登记，依照有关不动产登记的法律、行政法规执行。
依法登记的土地的所有权和使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。
第十三条 农民集体所有和国家所有依法由农民集体使用的耕地、林地、草地，以及其他依法用于农业的土地，采取农村集体经济组织内部的家庭承包方式承包，不宜采取家庭承包方式的荒山、荒沟、荒丘、荒滩等，可以采取招标、拍卖、公开协商等方式承包，从事种植业、林业、畜牧业、渔业生产。家庭承包的耕地的承包期为三十年，草地的承包期为三十年至五十年，林地的承包期为三十年至七十年地承包期届满后再延长三十年，草地、林地承包期届满后依法相应延长。
国家所有依法用于农业的土地可以由单位或者个人承包经营，从事种植业、林业、畜牧业、渔业生产。
发包方和承包方应当依法订立承包合同，约定双方的权利和义务。承包经营土地的单位和个人，有保护和按照承包合同约定的用途合理利用土地的义务。
第十四条 土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决商不成的，由人民政府处理。
单位之间的争议，由县级以上人民政府处理人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。
当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。
在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。