区别
大部分的神并非是人类修炼而来的，是人死后被册封而来。神有其司职。
仙是人类(或者妖类)修炼长生，或死后转化而来，通常无有司职。
神大致可以分成四类：
第一类是至高神。《说文解字》中解释“神”为：“天神，引出万物者也。” 这就是神的最初含义。 比如道教的老子，三清，元始天尊，玉皇大帝等等。
第二类是自然神。比如日神，月神，山神，河伯等等。这应该是原始崇拜的残留。 《庄子．逍遥游》中说：藐姑射之山，有神人居焉，肌肤若冰雪，绰约若处子，不食五谷，吸风饮露，乘云气，御飞龙，而游乎四海之外。这应该也算是一种自然神。
第三类是体内神。道教认为人身体内各个器官都有神明掌管，比如三尸神，五脏神等等。《黄庭经》第七章开始列举了一系列的体内神的名字，以便冥思。这也是为何冥思又叫存神的原因。 发神苍华字太元，脑神精根字泥丸， 眼神明上字英玄，鼻神玉垄字灵坚， 耳神空闲字幽田，舌神通命字正伦，
第四类则是数量最多的一类神，即鬼神。通常是在人死后，由崇拜者或者信徒推举为神，或者政府官方册封为神。比如伍子胥被民间信奉为钱塘潮神。著名的小说《封神演义》就 是在描写这一类神。又如三言中的《任孝子烈性为神》讲述的就是这种情况。《聊斋》中死后被封为城隍神，土地神一类的更是数不胜数。
仙
仙字初做仙。《说文解字》中解释“仙”为：“长生仙去。”仙是迁（迁）的意思。 仙则是后起字，《说文》未有。《释名》中解释仙字为：“老而不死曰仙。”
所以 仙则通常是活人修行后长生所达到的称号。 后来道家演绎得越来越复杂。
葛洪的《抱朴子》将仙分为三类：
上士举行升虚，谓之天仙；
中土游於名山，谓之地仙；
下士先死後蜕，谓之屍解仙。 此时就不仅仅是活人长生才是仙了，也包括活人修炼成仙未果，但是死后变成尸解仙的观点了。但是尸解仙与神仍然不一样，不需要册封。 再到后来演绎就更加复杂。有五仙之说：天，地，神，人，鬼。这时候，因为有神仙一说，所以神和仙的界限开始不分明，混用了。但是这里的神仙是特指仙的一种。 五仙的具体解释可以参考托名钟离权和吕洞宾对话的《钟吕传道集》中的解释。
参考资料