法律分析：1、二者行政级别有区别：
派出所所长应该是乡科级副职或股级正职干部；县区公安局局长是乡科级正职领导干部。
2、二者权限有区别。主要是：
（1）公安派出所是公安局的派出机构，派出所要服从所在公安局的领导，当然派出所所长要接受公安局局长的领导；
（2）派出所一般不能以自己的名义对行为人进行处罚（少数治安案件除外），但公安局可以以自己的名义独立办理治安案件和刑事案件，可以依法对行为人做出处理；
也就是说，公安局长的职责与权限，比派出所长要大的多。
3、二者岗位职责有区别：
派出所所长负责主持派出所的全面工作。
法律依据：《中华人民共和国公务员法》 第十六条 公务员职务分为领导职务和非领导职务。领导职务层次分为：国家级正职、国家级副职、省部级正职、省部级副职、厅局级正职、厅局级副职、县处级正职、县处级副职、乡科级正职、乡科级副职。非领导职务层次在厅局级以下设置。