1.悠久的历史，源远流长。
南京原称金陵，是中华文明的重要发祥地。到老朱建国时已经有7000多年的文明史，2500多年的建城史和近500年的作为首都的历史了，在是中国四大古都（西安、洛阳、北京、南京、）中，南京还是唯一未做过异族政权首都的古都，被被为汉族的复兴之地；在历史上具有特殊地位。
尤其是西晋末年天下大乱时，中原大地的士族相随南逃，中原政权也随之南迁。有了衣冠南渡之说。即缙绅和士大夫等避乱南方并落地南京及其附近生根，发芽。西晋末晋元帝司马睿渡江后定都建康（今南京）建立了东晋。
唐“安史之乱”后，中原士庶避乱南徙至金陵（今南京），建立南唐。
中国历史上三次衣冠南渡，就有两次把都城放在南京。（南宋衣冠南渡定都杭州）。
这使金陵保存了浓郁的华夏文化，显然让老朱了动了心。
2.比较老朱看中的其它城市，南京的地理位置得天独厚。
1356年 ，老朱修南京城的时候南京明故宫建筑标准就是依皇宫标准建造的。建国后，朱元璋感觉，南京地处东南，不利于西北边防，又有在凤阳，北京，开封建都的想法，都由于地理位置与名气等原因放弃了。
明秦愍王朱顶多， 之国之后，老朱喜欢上了古色古香的西安，有迁都到西安的想法，曾经为此策划与宣传过。还特意派稳重的太子朱标巡视过陕西，为迁都做准备。朱标为此奔波效劳，跑遍陕西的山水后，献上了陕地地图，可惜不久他英年早逝了此事也遭搁浅。
大明初建时，北方边患严重的，如果置首都于边疆，显然，不利于政权稳固。
而南京地处鱼米之乡的江浙一带，寒冷与饥荒不可能威胁到首都；游牧民族作为外患，又比较遥远，从北到南有万水千山作为屏障，相对来说是安全的，定都于此，税收也有保障。
3.从中国古代堪舆术（即相地术，俗称风水术，它是一门历史悠久的玄术）来看，南京虎踞龙盘，有京陵王气！老朱好这口。
金陵是南京最雅致的别称。早在公元前333年，楚威王熊商于石头城筑金陵邑，金陵之名源于此。
三国时，孙权也在此建都，使金陵作为城市风生水起。使黄河文化洗染了长江流域及整个中国南方地区，成为了中国南方的政治、经济、文化中心 。
六朝时期，金陵户口已达28万之众，总人口超过了百万，是当时世界第一个人口超过百万的城市！
所以，老朱经深思熟虑后，把首都放在南京，可谓慧眼识珠了！