区别在于逆转录病毒只有一种产生蛋白质的方法，即逆转录，而RNA病毒有正译，负译，逆转录多种产生蛋白质的方法。逆转录病毒是RNA病毒的一种,两种病毒是包含关系。
RNA病毒是生物病毒的一种，属于一级。 它们的遗传物质是由核糖核酸组成（RNA ribonucleic acid），通常核酸是单链的(ssRNA single-stranded RNA),也有双链的（dsRNA double-stranded RNA）.单链的RNA病毒根据他们的翻译意义可分为正译、负译和双向翻译的RNA病毒，正译的RNA病毒与mRNA相似，可以直接被宿主细胞翻译成蛋白质；负译RNA病毒则需要借助RNA酶的作用，以自身为模板编译出与原病毒相反义的RNA，之后再以此RNA来翻译成蛋白质。RNA病毒（RNA virus) 也称RNA型病毒。植物病毒，除少数例外（如花椰菜花叶病毒Caulif- lower mosaic virus），几乎都是RNA病毒。RNA病毒冠状病毒直径为80～160nm，为有包膜的单股RNA，病毒RNA的复制过程中，其错误修复机制的酶的活性很低很低，几乎是没有的，所以其变异很快。而疫苗是要根据病毒的固定基因或蛋白进行开发制作的，所以RNA病毒 疫苗较难开发。繁殖：是专性活细胞内寄生物。它不可单独进行繁殖，必须在活细胞内才可进行。RNA病毒有：艾滋病病毒，烟草花叶病毒，SARS 病毒，MERS病毒，埃博拉病毒（EBV），西班牙流感病毒，甲型H1N1流感病毒，禽流感病毒，噬菌体（有一部分噬菌体是DNA病毒，如T2噬菌体）等。
逆转录病毒（Retrovirus），又称反转录病毒，是RNA病毒的一种，它们的遗传信息不是存录在脱氧核糖核酸（DNA），而是存录在核糖核酸（RNA）上，此类病毒多具有逆转录酶。
反转录病毒的DNA基因组整合在宿主染色体上的位点是随机的。每个受感染的细胞一般有1～10份前病毒拷贝。反转录病毒DNA的整合是复制病毒RNA的必经阶段。反转录病毒的DNA插入宿主细胞染色体时，在5’LTR的U3左端和3’端LTR的U5右端各丢失2 bp，而在宿主染色体插入位点上生成4～6 bp的重复序列。只有当受感染细胞处于细胞分裂期间，反转录病毒DNA基因组才能接触到宿主细胞的遗传物质。因此，反转录病毒只能在分裂中的细胞内复制。
逆转录病毒和RNA病毒属于两种分类法，存在很大交集，但也有例外。我们熟知的传统病毒分类法是按照遗传物质简单分为DNA病毒和RNA病毒两大类的。但是病毒种类很多，种与种之间差异很大，这种分类法过于武断。现在更多地使用Baltimore分类法。这种分类方法的依据是，产生病毒真正直接致病的蛋白的信使RNA的生成方式。现将病毒分为七大类。（引用自维基百科Virus classification）1. 双链DNA病毒，如腺病毒、疱疹病毒、痘病毒。它们和其他自然界生物一样，遗传物质是双链DNA，转录产生致病mRNA2. 单链DNA病毒，如细小病毒。它们的遗传物质为单链DNA，先通过复制产生另一条互补链得到双链DNA，再转录产生致病mRNA。2. 单链DNA病毒，如细小病毒。它们的遗传物质为单链DNA，先通过复制产生另一条互补链得到双链DNA，再转录产生致病mRNA。2. 单链DNA病毒，如细小病毒。它们的遗传物质为单链DNA，先通过复制产生另一条互补链得到双链DNA，再转录产生致病mRNA。3. 双链RNA病毒，如呼肠病毒。它们的遗传物质为双链RNA，直接拿来就有致病mRNA。4. 正链单链RNA病毒，如微小RNA病毒、囊膜病毒。它们的遗传物质是正链单链RNA，先通过依赖RNA为模板的RNA聚合酶（RdRP）合成负链，这条负链再转录产生后来的致病mRNA。
负链单链RNA病毒，如正粘病毒（包括流感病毒）、炮弹病毒（包括狂犬病病毒）。
它们的遗传物质是负链单链RNA，转录得到致病mRNA。6. 单链RNA反转录病毒，如HIV。它们的遗传物质为单链RNA，无所谓正负，先反转录合成cDNA，再由cDNA转录得到致病mRNA7. 双链DNA反转录病毒，如嗜肝病毒。它们的遗传物质是双链DNA，偏偏喜欢先转录成RNA，再反转录为cDNA，再转录产生致病mRNA。7. 双链DNA反转录病毒，如嗜肝病毒。它们的遗传物质是双链DNA，偏偏喜欢先转录成RNA，再反转录为cDNA，再转录产生致病mRNA。7. 双链DNA反转录病毒，如嗜肝病毒。它们的遗传物质是双链DNA，偏偏喜欢先转录成RNA，再反转录为cDNA，再转录产生致病mRNA。以上的6和7就属于反转录病毒。
