宝鸡市中医医院特色科室包括针灸康复风湿病科和传统医学治疗中心。针灸康复风湿病科作为陕西省重点中医专科，拥有30张床位和15名医务人员，其中高级职称4人，中级职称6人。科室配备有中药熏蒸仪、经络导平等先进设备，采用中西医结合治疗，对中风、面神经麻痹、风湿关节疼痛、颈椎病等症状有显著效果，尤其在早期针灸介入治疗脑血管疾病方面表现突出，有助于患者恢复和提高生活质量。
传统医学治疗中心聚集了4名专业推拿人员，设有多个治疗室，如小儿推拿室、成人推拿室等，提供药浴熏蒸、按摩、足疗等服务。中心治疗范围广泛，包括颈椎病、腰椎病、小儿斜颈等，特色技术如小儿推拿、药浴熏蒸和浴足疗法，针对不同病症有独特疗效。
心血管病诊疗中心是市级重点医学专科，由正高职称2人，副高职称3人等技术骨干组成，设备先进，尤其在冠心病、心律失常、心血管介入治疗等方面具有很高水平。近年来，科室业务拓展迅速，开展了多项先进检查和治疗技术，如运动试验、心电监测等，并积极引进和开展心血管介入手术，每年完成大量手术，为患者提供高质量的医疗服务。
宝鸡市中医医院为一所中医特色突出、西医优势明显的综合性现代化三级甲等中医医院。医院目前开放床位1010张（其中斗鸡分院300张，县功分院110张），年门诊20万人次，出院1.4万人次。医院在岗职工1070人，其中卫生技术人员933名，占87％；高中级专业技术人员365名（高职95人），占卫生技术人员的39％。有硕士生导师2人，享受国务院特殊津贴1人，市级有突出贡献拔尖人才7人。