准予从销项税额中抵扣的进项税额，分两类：
一类是以票抵扣，即取得法定扣税凭证，并符合税法抵扣规定的进项税额；另一类是计算抵扣，即没有取得法定扣税凭证，但符合税法抵扣政策，准予计算抵扣的进项税额。
1、以票抵税
（1）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额；
（2）从海关取得的完税凭证上注明的增值税额。
2、计算抵税
（1）外购免税农产品：进项税额=买价*13%
（2）外购运输劳务：进项税额=运输费用*7%
（3）生产企业收购免税废旧物资：
进项税额=普通发票注明的金额*10%。
注意：
（1）税法规定：一般纳税人向农业生产者购买的免税农业产品或向小规模纳税人购买的农业产品准予按买价和13%的扣除率计算进项税额，从当期销项税额中扣除。（注：13%的扣除率自2002年1月1日起实行，在此之前扣除率为10%）。
计算公式：进项税额=买价（包括农业特产税）*13%
注意问题：第一，购买的免税农产品必须是农业生产者（个人、单位、小规模纳人）自产自销的种植或者养殖的初级农业产品；第二，其买价仅限于税务机关批准使用的收购凭证上注明的价款（含农业特产税）。
应用举例：某收购站2005年7月从果园收购水果1000公斤，每公斤收购价4元，款项已支付。另支付农业特产税200元。进项税额=（1000*4+200）*13%=546元
（2）税法规定：一般纳税人外购货物（除固定资产）和销售货物所支付的运输费用，准予按运费结算单据所列运费和7%的扣除率计算进项税额抵扣。（注：7%的扣除率自1998年7月1日起实行，在此之前扣除率为10%）
计算公式：进项税额=运费金额（即运输费用+建设基金）*7%
注意：纳税人购销免税货物（购进免税农业产品除外）支付的运费，以及纳税人外购固定资产支付的运费，不得按7%计算抵扣进项税额。另外还要注意抵扣时间问题：纳税人2003年10月31日以后开具的运输发票，应在开具之日起90天内向主管税务机关申报抵扣，逾期不得抵扣进项税额。
应用举例：某生产企业外购原材料取得增值税发票上注明价款100000元，已入库，支付运输企业的运输费800元；（货票上注明运费600元、保险费60元、装卸费120元、建设基金20元）
进项税额=100000*17%+（600+20）*7%=17043.元
（3）税法规定：自2001年起，专门从事废旧物资经营的一般纳税人销售废旧物资免征增值税。生产企业增值税一般纳税人购入的废旧物资回收经营单位销售的废旧物资，可按照废旧物资回收经营单位开具的由税务机关监制的普通发票上注明的金额，按10%计算抵扣进项税额。
计算公式：进项税额=普通发票注明的金额*10%
注意问题：此规定只适用于生产企业增值税一般纳税人，且收购的废旧物资来源于废旧物资回收经营单位。另外还要注意抵扣时间问题：纳税人取得2004年3月1日以后开具的废旧物资发票，应在开具之日起90天后的第一个纳税申报期结束前向主管税务机关申报抵扣，逾期不得抵扣进项税额。
应用举例：某钢厂从废旧物资回收单位收购一批废钢铁，取得普通发票上注明价款为70000元，另支付运输企业运输费2000元。（有发票）
进项税额=70000*10%+2000*7%=7140元
计算增值税，还有其他一些规定：比如进项税额转出、小规模纳税人应纳税额计算的简易办法、兼营不同税率的应税货物或应税劳务、混合销售行为、兼营非应税劳务、电力产品应纳增值税的计算及管理、出口货物退（免）税等，具体如何操作，你应以你单位的具体情形参照注册会计师全国统一考试教材之税法第二章增值税法的有关规定和举例，相信对你有很大的帮助。
参考资料：2005年注册会计师全国统一考试指定用书配套辅导轻松过关1