法律分析：主要区别如下：第一，部门性质不同：交通管理局是国家的机关职能部门，交警队是执法部门。第二，部门级别不同：交通管理局是组织、指导和监督地方公安机关依法查处道路交通违法行为和交通事故的国家机关，是管理交通的最高机构。交警队隶属交通管理局管理。
法律依据：《中华人民共和国道路交通管理条例》第七条：机动车辆使用前，必须向公安交警部门申请登记，领取号牌、行驶证并按规定办齐随车必备的证件。
《交通警察道路执勤执法工作规范》第二条：交通警察在道路上执行维护交通秩序、实施交通管制、执行交通警卫任务、纠正和处理道路交通安全违法行为等任务，适用本规范。
第三条：交通警察执勤执法应当坚持合法、公正、文明、公开、及时，查处违法行为应当坚持教育与处罚相结合。