猫的支原体感染临床上表现为结膜炎（包括肛门出现红肿)、大量眼鼻分泌物、喷嚏、肺炎等。诊断上，国内兽医基本依据临床症状拟诊，少数兽医师能够通过衣原体的包涵体诊断。但这些诊断都有很大的不确定性。原因是猫衣原体常常和猫的一些病毒性疾病并发。兽医往往在临床上强调了病毒性疾病的治疗，而对衣原体的感染按照继发的细菌感染处置。
猫衣原体的治疗通常考虑支持疗法和抗生素治疗。抗生素通常有两个选择，一类氟喹诺酮类，另一类是强力霉素。治疗的疗程较长，需要40多天。此病如没有并发病毒如FHV感染，大都预后良好。如果猫咪出现症状，请及时到宠物医院就诊。
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