因为如果把人体中所有细胞都算在内的话,估计只有43%与人类有关。如果从基因上来看,我们更是处于下风。人类基因组大约由2万个基因组成,但人体中的微生物群的基因大约在200万到2000万个之间。人体中的微生物群是我们身体中的第二个基因组,每个人都是由自身的DNA再加上人体中微生物的DNA结合起来的。而这些微生物群与人体有着互动并影响着人体。人类微生物群系又称为正常菌群,是某些微生物与宿主在长期的进化过程中形成共生关系,对宿主无害的一类细菌。它们包括了细菌、真菌、古菌和病毒。这些微生物群主要寄宿在人体的皮肤、外耳道、眼结膜、鼻咽腔、尿道、肠道、消化道和阴道等部位。
如果正常菌群与宿主之间,或正常菌群各菌种间的平衡被打破,就会出现菌群失调,致病作用就会显著,严重者会引起二重感染。