在21世纪人类经济高度发展的同时，也造成环境严重破坏与污染，使人们的健康遭受到严重的威胁，于是整治各种污染的环境保护措施迫在眉睫，从中央到地方，无不将其列为首要的施政重点。其中水污染的程度已经造成生态的严重失衡，大自然因过度的污染而失去了原有的氮循环自净能力，所以藉由水处理方法是修复大自然生态的必须法门。
而在众多的污水处理方法中，生物处理法因为工艺简单、成效显著、成本低廉、纯天然环保、无二次公害等优点，在全世界都是最主要的污水处理工艺。其中生物膜法、生物滴虑法、活性污泥法或加入生物制剂等方法，都是利用生物的分解能力达到净化水质的目的。但目前市面上大多的微生物处理仅靠存在于废水污泥中自发菌之作用，由于现代工业化污水中的污染源种类相当复杂，而分解污染物的生物菌种类不全，该有的不存在，而不必要者又偏多，往往因为有效菌数量不足或菌种分解能力不够，降解污染能力欠佳，以致于处理效果不易控制，有时还需凭借运气，此种情形往往使投资兴建设备之业主丧失信心，无所适从。
第三代BIO-1污水处理菌种 的技术核心技术在于“以生物技术修复受污染水体氮循环自净能力”，所有的菌种源自于大自然，加以人工培育驯化，最终回归大自然，担任修复水体氮循环的使命，符合无毒、无公害、无二次污染、对人体无害的原则。能有效去除氨氮、BOD、COD、SS、硝酸根、硫酸根、色度、臭味、毒性物质、化合污染物等，而不需化学混凝、助凝过程。
作用机理
一、好氧性微生物污水处理菌种利用水中的溶氧（DO），将有机污染物质分解成水和二氧化碳，或转化为污水处理微生物的营养物质，并利用这些养分进行繁殖，其过程正好可以降解污染物质，达到除污除臭的目的，此种处理法称为好氧性处理，利用最多的就是活性污泥法。
二、通用厌氧性污水处理微生物是在没有溶氧的环境下将硝酸盐还原（利用硝酸盐中的氧），进行脱氮反应，使其产生氮气，此种方广泛运用于含有氮气的废水处理。而酸生成菌（通用厌氧性微生物）常用于绝对厌氧微生物污水处理工法中的前期酸化反应。
三、绝对厌氧性生物处理是利用酸生成菌进行酸化反应，将污水中的醣类或蛋白质分解成单醣类、胺基酸或低级脂肪酸（有机酸）。再以醋酸生成菌（绝对厌氧性微生物）将污水中的单醣类、胺基酸或有机酸分解成醋酸。最后再以甲烷生成菌（绝对厌氧性微生物）分解醋酸生成甲烷。
四、多数的污水处理微生物以污染物为食，比如碳水化合物类、蛋白质类和脂肪类等污染物，都能被各种污水处理微生物分解，使其成为自身生长繁殖的养分。而利用光合细菌和芽孢杆菌等，能将恶臭气体硫化氢转化成自身生长所需要的硫元素，进而达到除臭的效果。
五、微生物污水处理菌种本身具有的多糖类黏性物质，能利用来吸附环境中的污染物，此种特性常被运用来对重金属离子的吸附。
六、经过特殊微生物污水处理菌群进入到污水中时，会成为环境中的优势菌，能抑制病原菌和腐败菌的生长，比如乳酸菌等成为优势菌后，就能抑制环境中大肠杆菌等的生长，从而减少氨气等臭味的产生。