机身外观差异，电信版iPhone 4S机器型号为A1387，与国际版苹果iPhone 4S一致，而WCDMA制式的移动版iPhone 4S机器型号为A1431，电信版iPhone 4S背部拥有“cdma2000数字移动电话机”标识，而移动版没有。
系统方面，两款手机的设置项目中存在诸多细节上的差异。例如相比移动版iPhone 4S，电信版iPhone 4S的设置项目中取消了运营商，因此电信版只能默认使用中国电信的手机卡。
电信版iPhone 4S相比移动版在“设置”选项中的“关于本机”中，增加了一个MEID码。MEID是分配给CDMA制式的手机的56bit移动终端标识号，具备全球唯一性。标识号需被烧入终端，并且不能被修改，可用来对移动式设备进行身份识别和跟踪。
在网络设置项目中，电信版iPhone 4S取消了“启用3G”开关功能，但是比联通版iPhone 4S增加了“漫游”功能，分别可选语音漫游、数据漫游和CDMA国际漫游。
在网络制式方面，是两款手机差异最大的地方。在频段上，电信版iPhone 4S支持的频段更多，包括GSM 850/900/1800/1900MHz、WCDMA 2100MHz、CDMA2000 1X EVDOMHz，而移动版仅支持GSM 850/900/1800/1900MHz、WCDMA 2100MHz频段。