饲料微生物是指那些作为家畜、家禽和鱼类饲料的微生物，以及那些用于加工或改善饲料质量的微生物。随着人们对这些微生物的认识和利用不断发展，饲料微生物在农业生产中的重要性日益凸显。
微生物制剂，也被称为微生态制剂或益生素，是指那些对动物生长发育具有促进作用的微生物以及微生物提取物和代谢产物的总称。作为一种新型的活菌饲料添加剂，微生物制剂具有抗生素和酶的功能。
在反刍动物的日粮中添加适量的微生物制剂可以改善肠道微生物菌群，增强动物的抗病能力，促进生长，提高幼畜的存活率，减少或防止腹泻，提高饲料的利用率和生长速度，改善肉和奶的品质。而且，这些微生物制剂具有无残留、无污染和无副作用的特点。
地衣芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、粪肠球菌、酿酒酵母等都是中国农村农业部发布的《饲料添加剂品种目录（2013）》中批准使用的饲料微生物。目前，乳酸菌制剂、芽孢杆菌制剂、真菌及活酵母类制剂等微生物制剂被广泛使用。
微生物发酵饲料的好处包括：
1. 提高饲料的转化率：通过微生物的发酵，可以提高饲料原料的消化吸收率。在发酵过程中，不同的菌种会产生不同的酶，这些酶可以将动物难以消化吸收的粗纤维、粗蛋白、淀粉、果胶等物质降解成易消化吸收的小分子，如葡萄糖、氨基酸、寡糖、多肽等，从而提高饲料的消化吸收率。
2. 提高饲料的营养水平：乳酸菌、酵母菌、脂肪菌等益生菌可以进一步合成饲料中的各种成分，如氨基酸、蛋白质、维生素、有机酸等。利用微生物生长繁殖快、增殖率高、代谢能力强的特性，可以产生大量的菌体和代谢产物。微生物的菌体营养丰富，其细胞与其他生物细胞的化学组成没有本质上的差异。
3. 增强动物自身的免疫力：动物体内寄居着大量的微生物，这些微生物之间相互制约、相互影响，形成相对平衡的状态。在和平共处的条件下，益生菌群可以广泛分布于肠粘膜表层，形成生物屏障，通过占位性保护排斥病原微生物，增强动物的免疫力。
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