松阳县建设局设有多个内设机构，每个部门承担着不同的职能：
办公室: 负责机关政务的协调、督查、文电处理、对外联络和接待，新闻宣传、综合会议组织、文件起草、核稿、文秘档案管理、提案议案处理、后勤服务、人事劳动、建设行业教育培训、社会团体指导、执业资格注册和法制宣传教育、党群工作以及离退休人员管理。
计划财务科: 制定建设事业发展规划，参与产业政策，编制城市投资计划、统计管理、财务审计、预算计划、行政事业收费项目、国有资产管理工作。
规划科: 负责城市和村镇规划，包括规划编制、审查、报批，城市建设地块规划，测绘管理，土地资源配置，以及规划监察指导。
建筑业管理科: 管理建筑行业，制定政策，规范市场，负责招投标、施工许可、质量监督、资质管理，以及建筑业监察工作。
城市公用事业管理科: 管理城市基础设施，如道路、供水、排水、燃气、交通、市容环卫等，资质管理，指导节水和生物多样性保护，监督市政公用事业工作。
住宅与房地产业管理科: 负责住宅与房地产行业管理，制定政策，规范市场，负责房地产转让、抵押、租赁，城镇土地使用，住宅产业化、房地产开发和中介服务组织的资质管理，商品房预售管理和房屋装饰装修管理，监督房地产市场。