农村土地确权有争议的处理方法如下：
1、协商解决：在发现土地确权争议时，首先应该尽量通过协商的方式解决。当事人可以通过双方协商，或者委托第三方协调，达成一致意见并签署相关协议，以确保土地确权工作的顺利进行。
2、提交申诉：如果协商无果，当事人可以向当地国土资源部门提交申诉书，要求进行调查和处理。申诉书应当包含争议的事实和理由，并提供相关证明材料。
3、调解处理：国土资源部门收到申诉后，会对争议进行调查和处理。如果调查发现确有争议，国土资源部门会组织相关方面进行调解，以达成一致意见。
4、诉讼解决：如果调解无法达成一致意见，当事人可以向法院提起诉讼，让法院根据法律规定进行裁决。
办理农村土地确权需要的资料如下：
1、房产证或自建房房屋所有权证明：需要提供房产证或自建房房屋所有权证明，证明该土地上的房屋归申请人所有；
2、公民身份证：需要提供身份证原件和复印件，证明申请人的身份；
3、农村集体土地证：需要提供农村集体土地证原件和复印件，证明该土地属于农村集体所有；
4、家庭户口簿或证明：需要提供家庭户口簿或户口证明原件和复印件，证明申请人的家庭情况；
5、土地调查表：需要填写土地调查表，对申请的土地进行详细描述，包括土地面积、地形地貌、土地用途等；
6、村民委员会或村镇政府出具的意见：需要提供村民委员会或村镇政府出具的意见，证明该土地确权申请符合当地的土地管理政策。
综上所述，在处理确权问题时需要注意保护自己的合法权益，避免出现不必要的损失。
【法律依据】：
《中华人民共和国确定土地所有权和使用权的若干规定》第二十七条
土地使用者经国家依法划拨、出让或解放初期接收、沿用，或通过依法转让、继承、接受地上建筑物等方式使用国有土地的，可确定其国有土地使用权。
第二十八条
土地公有制之前，通过购买房屋或土地及租赁土地方式使用私有的土地，土地转为国有后迄今仍继续使用的，可确定现使用者国有土地使用权。
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