《修改更正通知书》由专利审查部门发出，目的是更正已经发生的错误。如：
因银行或者邮局责任造成必要缴费信息不全被退款，当事人重新缴纳了已被退回的款项，原缴费日视为重新缴纳款项的缴费日，因此导致已作出的处分决定需要更改的，审查员应当发出修改更正通知书；
专利局受理处或者代办处在受理工作中出现的错误一经发现，应当及时更正，并发出修改更正通知书，同时修改有关数据；
作出丧失专利申请权(或专利权) 的处分决定后又收到有关文件表明相关手续已在规定的期限内完成的，流程部门应当及时撤销有关处分决定，发出修改更正通知书，处分决定已公告的还应当作出公告更正。
《补正通知书》则是由于申请人所提交的材料中存在可以通过补正克服的缺陷，审查员发出补正通知书，明确指明专利申请存在的缺陷并说明理由。目的是令申请人通过补正或意见陈述来克服缺陷，提交符合法律法规的材料。