鸡体患病后，其体内各器官将发生相应的病理变化，因此，通过解剖，找出病变的部位，观察其形状、色泽等特征，结合生前诊断，从而可确定疾病的性质和死亡的原因。
（1）杀死病鸡的方法
病理剖检的对象是病鸡和病死鸡。临床上杀死病鸡的方法很多，常用的有以下几种。①断头：就是用锐利的剪刀在鸡颈部前端剪下头部。这种方法适用于幼雏。②拉断颈椎：用左手提起鸡的双翅，右手食指和中指夹住鸡的头颈相连处，拉直颈部，用拇指将鸡的下颌向上抬起，同时食指猛然下压，这样使脊髓在寰椎和枕骨大孔连接处折断。折断后应抓住鸡的双翅以防止扑打，直到挣扎停止。这种方法适用于大雏或青年鸡。③颈静脉放血：拔除颈部前端的羽毛，一只手将鸡的双翅和头部保定好，另一只手用锋利的剪刀在颈部左下侧或右下侧剪断颈静脉，使血液流出，直到病鸡因失血过多而死亡。这种方法适用于成年鸡。
此外，口腔放血法、脑部注射空气法等都可杀死病鸡。
（2）剖检前的准备
剖检室应设在远离鸡舍、孵化室和料库的地方。剖检前准备好必要的器械，如解剖剪、手术剪、手术刀、解剖刀、镊子、乳胶手套等。若要进行病原分离，上述器械要经过严格的消毒处理，一般采用高压灭菌处理的培养基和其他必需的器械、试剂以及鸡胚或培养中的细胞等，若要采集病料进行组织学检查，还要准备好固定液和标本缸等。
（3）体腔剖开
将鸡的尸体用水浸湿，仰卧于剖检台或剖检盘内，在两侧的大腿和腹部之间切开皮肤，用力下压两大腿并向外折，使股骨头和髋臼脱离，这样使两腿外展，防止尸体在剖检时翻转。
开始剥皮由口角沿腹正中线经气管、胸骨脊至泄殖腔切开皮肤，然后向左、右两侧剥开皮肤。剥皮时，应特别注意勿伤及嗉囊。
胸腔的剖开是自胸骨的后内突（后胸骨）后缘纵切腹壁至泄殖腔，再于胸骨后内突后缘向左右侧各切一与纵切垂直切线。然后将胸骨上的肌肉切下，沿胸骨两侧用解剖剪向前剪断肋骨、鸟喙骨和锁骨。左手握住胸骨，用力拉向前上方，剪断连续的软组织，取下胸骨放于一侧，这时内脏全部露出。
将结肠在与泄殖腔交界处结扎剪断，再于腺胃前剪断食管，摘出腺胃、肌胃及肠。用手术刀柄伸入肋骨间窝剥离出肺脏，于支气管分支口剪断气管，然后用镊子提持下剥离各部连结组织，将心脏、肝脏、肺脏和脾一起摘出，再用与摘出肺脏同样的方法剥离出肾脏。卵巢与输卵管同时取出。
用手术剪插入口腔，从喙角开始剪开口腔、食管、嗉囊及气管。
用剪刀将鼻孔上面的皮肤和上颌骨横向切开。鸡脑的摘出，是先除去颅部肌肉，用解剖剪或手术剪剪开颅盖，切线为前经眼角、后经枕骨大孔的环状切线，取下颅盖后，即可取出脑。
器官检查，一般多在颈部、胸部及腹部器官摘出后一起检查，也可在各部器官摘出后立即分别进行检查。