岑溪软枝油茶面临多种病害和虫害的威胁，主要包括炭疽病、软腐病、根腐病以及油茶毒蛾、油茶尺蛾和茶籽象甲等。
炭疽病是常见病害，主要影响果实、叶、枝和树干，导致果实开裂、叶片脱落、枝条枯死和树干溃疡，严重时会危及整株油茶的生存。防治策略是通过营林管理减少病源，增强树体抵抗力，并在春夏季节定期喷洒1%波尔多液进行预防，发病初期使用50%多菌灵进行治疗。
软腐病主要侵袭果实、叶、芽和梢，造成大量落叶和落果，芽梢死亡。防治上，除了营林措施外，改善通风透光条件，喷洒1%波尔多液也是有效的预防手段。
根腐病主要威胁1年生油茶苗，初期从根颈部位开始，引发根部腐烂和叶片凋落。防治方法包括清除病株，使用熟石灰拌土覆盖，或者使用50%退菌特、50%多菌灵等药物浇灌根部。
油茶毒蛾是间歇性爆发的昆虫，主要危害油茶的枝叶和花果。防治措施包括冬季和早春人工摘除卵块，秋冬季进行垦复灭蛹，在3龄幼虫阶段使用50%敌百虫乳液喷杀。
油茶尺蛾幼虫主要以叶片为食，防治时采取人工防治与化学防治相结合，如垦复灭蛹、人工捕蛾、刮卵，药物防治应在3龄幼虫前进行，推荐使用40%敌百虫800-1000倍液喷雾。
茶籽象甲成虫和幼虫分别危害果实和种仁，防治手段是在5-6月使用90%敌百虫1000-2000倍液喷雾，同时结合垦复消灭土壤中的幼虫和蛹，落果需收集后集中销毁。
岑溪软枝油茶是我国第一个油茶良种，以枝条韧软、挂果下垂而得名。具有速生、早实、高产等优良特性。是广西林科院采用实生繁殖、经过连续15年系统品种比较试验选育出来的优良品种，属普通油茶的一个农家品种。该品种已通过国家林木良种审定。有关专家认为，岑溪软枝油茶良种具有很高的推广利用价值。