贵阳医学院图书馆各部室职责清晰划分，共同维护图书馆运营。
办公室位于图书馆四楼，主要负责馆内日常事务处理，对外联络接待，协助馆长制定和修改工作计划、规章制度，组织会议和业务学习活动。文书、收发、公文处理及档案管理是其重要职责，同时协调馆际关系，管理财产、安全和卫生，参与教学工作，并处理非专业部室或馆长交办的其他任务。
采编部位于四楼，承担采访任务，根据教学科研需要采购图书，编制采购计划，并负责图书的分编、登录和加工工作。此外，还负责期刊资料的管理，编制目录索引，以及《医学文献检索》的教学工作。
期刊部负责期刊阅览室和期刊库的管理，处理中外文期刊的订购、整理等工作，同时进行科技期刊的宣传和教学工作，进行财产管理和统计。
流通部位于三楼，负责图书典藏和调度，管理借阅服务，发放和回收借书证，处理图书剔旧、转让等问题，并完成统计和财产管理工作。
技术部负责图书馆的网络维护、电子资源建设和电子阅览室管理，确保电子设施的完好，并进行《医学文献检索》的教学。
情报部主要提供情报服务，如咨询、检索和资料宣传，同时也负责本部门的国有资产管理和教学工作。
医学文献检索教研室则专注于教育改革，编制教学大纲，组织教学活动，提升师资队伍素质，进行教学方法研究，制定教学计划，并接受教学质量督导。
贵阳医学院图书馆建立于1938年，现有馆舍面积约13420.32平方米，藏书约69万余册，其中英、日、俄、德文书刊约10万余册，另有万方数据、Medline、中国医学生物学数据库、CMCC、中国生物学数据库、维普资讯、OVID（四个core collection）、OVID LWW、EBSCO等电子资源，同时，依托中国教育科研网和校园网可与省内高校共有共享中国学术期刊数据库、中国d-library等电子资源。图书馆现有工作人员32人，其中博士1人，硕士2人，副高职称11人。