养殖场一般都是以地下水为水源，自设供水系统，供水方式可分两种，一是各用水点分别由水源取水的分散式给水，除小规模饲养外，规模化养殖场很少采用；二是统一由水源取水，净化处理后通过配水管网送至各用水点的集中式给水。
无论何种供水都必须加强水源的保护：
（1）在水源周围100米以内，严禁捕捞、网箱养殖、停靠船只、游泳和从事其他可能污染水源的任何活动。
（2）取水点上游1000米至下游100米的水域不得排入工业废水和生活污水；其沿岸防护范围内不得堆放废渣，不得设立有毒、有害化学物品仓库、堆栈，不得设装卸垃圾、粪便和有毒有害化学物品的码头，不得使用工业废水或生活污水灌溉及施用难降解或剧毒的农药，不得排放有毒气体、放射性物质，不得从事放牧等有可能污染该水域水质的活动。
（3）以河流为给水水源的集中式供水，由供水单位及其主管部门会同卫生、环保、水利等部门，根据实际需要，可把取水点上游1000米以外的一定范围河段划为水源保护区，严格控制上游污染物排放量。
（4）养殖场自身要注重对水源的保护。不得堆入废弃物，并严禁设废水渗水坑、井；避免畜禽废弃物、养殖场污水直接排入江河；还应不断加强对取水、净化、蓄水、配水和输水等设备的管理，建立行之有效的放水、清洗、消毒、检修的制度及操作规程，以保证供水质量。