包括细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生动物.
微生物包括以下群种：
1.无细胞结构生物病毒：是一种可以在其它生物体间传播并感染生物体的 微小生物（其实因为病毒本身不能进行新陈代谢，所以某种程度上还不能说病毒是生物）
2.亚病毒：是一类比病毒更为简单，仅具有某种核酸不具有蛋白质，或仅具有蛋白质而不具有核酸，能够侵染动植物的微小病原体。
3.原核生物中的古细菌,真细菌,放线菌,蓝细菌,枝原体：是没有成形细胞核或线粒体的一类单细胞（或多细胞，例如：念珠藻）生物。
4.真核生物中的酵母菌,霉菌,单细胞藻类,原生动物：真核生物是其细胞具有细胞核的单细胞生物和多细胞生物的总称，它包括所有动物、植物、真菌和其他具有由膜包裹着的复杂亚细胞结构的生物。