区别如下：
M.D.医学博士Doctor of Medicine
中国大陆的医学教育与其他国家和地区有所不同，医学教育是从大学本科开始的，一般有五年制，七年制和八年制，分别授予医学学士，医学硕士和医学博士的学位。七年制和八年制统称为长学制。获得医学学士学位的毕业生，可以参加执业医师考试，通过后即可执业行医。
五年制毕业的医学学士，可以继续攻读医学硕士，一般需要3年，获得医学硕士以后，再攻读博士学位，一般需要2年。七年制毕业的医学硕士，可以继续攻读医学博士，如果攻读本校的医学博士，可以只参加转博考试，通过考试及面试后，再读3年，可以获得医学博士学位。
Ph.D.哲学博士Doctor of Philosophy
高级学衔之一，通常是学历架构中最高级的学衔。拥有人一般在大学本科（学士）及／或研究院（硕士）毕业后，再进行相当年数的研修后，撰毕论文并通过答辩，方获发哲学博士学位。
哲学博士的拥有人并不一定修读“哲学”。所谓哲学博士，是指拥有人对其知识范畴的理论、内容及发展等都具有相当的认识，能独力进行研究，并在该范畴内对学术界有所建树。因此，哲学博士基本上可以授予任何学科的博士毕业生。