总的来说,花龟和草龟的区别并不明显,主要可以从外表上来辨别。在辨别时,可以看它们的颈部。花龟和草龟的颈部都呈现黑色,但花龟颈部有一些细条状的黄色花纹,而草龟颈部的花纹是点状的,不规则分布。颈部的区别是它们主要的区别。此外,它们的习性也有一定的区别。草龟更偏肉食,长大后偶尔吃一些素食。而花龟荤素皆吃。两者相比,草龟的生长速度更慢一些。另外,成年的雄性草龟可能有墨化现象,通体变黑。而花龟没有此现象。
原则上,两种龟是可以混养在一起的。花龟和草龟之间体型相差不大,不会轻易发生大龟欺负小龟的问题。并且两种乌龟性格都比较温和胆小,一般也不会主动去攻击对方。再加上两种龟所喂养的龟粮也比较相同,在饮食方面不必费太多心思。因此两种龟可以养在一起,但也需要注意因产生领地意识而出现龟与龟之间互相啃咬的现象。