尿道结石应与以下疾病相鉴别。
（1）尿道狭窄：无肾绞痛及排石史，多数有损伤、炎症或先天性、医源性等原发病因，排尿困难非突发性。尿道探查可于狭窄部位受阻。
X线平片无结石影。尿道造影可显示狭窄段。
（2）非特异性尿道炎：无肾绞痛及排石史，无急性排尿困难，体格检查不能触及结石，X线平片无结石影。
（3）尿道痉挛：无排石史及尿频尿急等症状，体格检查不能触及结石。尿道探子可正常通过尿道，X线检查无异常，用镇静药后症状可缓解。
（4）尿道异物：有明确病因，X线检查可见尿道内充盈缺损或异物阴影，尿道镜检查可见异物。