法律分析：依据我国相关法律的规定，民事合同纠纷法院普通程序审理的期限为6个月，简易程序为三个月，二审为三个月，如果简易程序超三个月的，可以转为普通程序，如果是二审的，可以延长审理期限。民事合同纠纷法院开庭三个月未判决应该是普通程序，普通程序审理期限为6个月，所以会应该在剩下的3个月里判决。
法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》
第一百四十九条 人民法院适用普通程序审理的案件，应当在立案之日起六个月内审结。有特殊情况需要延长的，由本院院长批准，可以延长六个月；还需要延长的，报请上级人民法院批准。
第一百六十一条 人民法院适用简易程序审理案件，应当在立案之日起三个月内审结。
第一百七十六条 人民法院审理对判决的上诉案件，应当在第二审立案之日起三个月内审结。有特殊情况需要延长的，由本院院长批准。人民法院审理对裁定的上诉案件，应当在第二审立案之日起三十日内作出终审裁定。