全站仪建立坐标系的流程方法如下：
1、选择测量地点其中一点设站，架全站仪，另一点放棱镜；
2、点击数据采集，输入测站点（就是放仪器点）的坐标和仪器高；
3、输入定向点（就是不架仪器的一点）坐标，棱镜高输不输都行；
4、仪器瞄准棱镜，点击测量，看一下显示的坐标和输入点的坐标差别大不大，不大的话定向完成。差别太大重复2、3步骤；
5、设定测站点的三维坐标；
6、设定后视点的坐标或设定后视方向的水平度盘读数为其方位角。当设定后视点的坐标时，全站仪会自动计算后视方向的方位角，并设定后视方向的水平度盘读数为其方位角，设置棱镜常数；
7、设置大气改正值或气温、气压值；
8、量仪器高、棱镜高并输入全站仪；
9、照准目标棱镜，按坐标测量键，全站仪开始测距并计算显示测点的三维坐标。
扩展资料：
一、全站仪建立坐标系的注意事项：
1、注意棱镜高和一起输入的棱镜高一致；
2、仪器断电需要重新定向；
3、对于看不到地点设置转站最多两站。放样方法：根据已知的两个坐标点给全站仪定向，然后输入要放地点的坐标，全站仪会显示角度和距离；
转动全站仪，使显示角度接近零，然后拿着棱镜沿镜头指向走显示的距离，用全站仪瞄镜子，点测量，看显示的角度和距离误差，不断调整。距离误差1-2mm，角度差+-（1-2）秒。
4、全站仪仪器的盘左和盘右，实际上沿用老式光学经纬仪的称谓。是根据竖盘相对观测人员所处的位置而言的，观测时当竖盘在观测人员的左侧时称为盘左，反之称为盘右。相对盘左和盘右而言也有称为正镜和倒镜，以及F1(FACE1）面和F2(FACE2）面的。
5、对于测量来讲，若正、反（盘左、盘右）测量后，通过测量方法有可消除某些人为误差以及固定误差的作用。对于可定义盘左和盘右称谓的仪器而言，给用户增加了应用仪器的可选操作界面，对测量作业和测量结果没有影响。
6、对于靠角度确认盘左和盘右可能存在某些错觉，例如某些连接陀螺仪的全站仪或者经纬仪，在确定盘左和盘右时显示的不一定是对应。就是说相对180度角度数值而已往小向转不一定是盘左。反正，用户记住两者的差值即可。仪器也是自动求算的，对工程测量结果没有影响。
二、全站仪的使用注意事项：
1、照准部水准轴应垂直于竖轴的检验和校正检验时先将仪器大致整平，转动照准部使其水准管与任意两个脚螺旋的连线平行，调整脚螺旋使气泡居中，然后将照准部旋转180度，若气泡仍然居中则说明条件满足，否则应进行校正。
校正的目的是使水准管轴垂直于竖轴。即用校正针拨动水准管一端的校正螺钉，使气泡向正中间位置退回一半。为使竖轴竖直，再用脚螺旋使气泡居中即可。此项检验与校正必须反复进行，直到满足条件为止。
2、十字丝竖丝应垂直于横轴的检验和校正。检验时用十字丝竖丝瞄准一清晰小点，使望远镜绕横轴上下转动，如果小点始终在竖丝上移动则条件满足．否则需要进行校正。
校正时松开四个压环螺钉（装有十字丝环的目镜用压环和四个压环螺钉与望远镜筒相连接。转动目镜筒使小点始终在十字丝竖丝上移动，校好后将压环螺钉旋紧。
参考资料来源：百度百科-全站仪
参考资料来源：百度百科-电子全站仪