转基因木瓜，是为了解决番木瓜环斑病毒带来的木瓜产业下降问题的新型产品，初产于美国，现已进口至中国、加拿大、日本、泰国等地。
中国的木瓜产地在华南地区，而华南地区有4个番木瓜环斑病毒毒株，其中"黄点花叶"株是优势毒株(80%以上的发病木瓜携带这个毒株)。华南农业大学的科研人员将这个毒株的复制酶基因转入木瓜体内，培育出了"华农1号"。该品种不仅高抗"黄点花叶"株，对华南地区其他几个次要毒株也具有很好的抗性。"华农1号"在2006年获得中国农业部颁发的安全性证书，可在广东省生产应用。此后得以大规模种植，产生了巨大的经济效益，深受瓜农喜爱。目前国内市场上销售的木瓜基本上都是转基因品种
为什么"华农1号"的研究者选择转入番木瓜环斑病毒的复制酶基因，而不是跟别的抗病毒作物、甚至夏威夷的转基因木瓜一样，也转入病毒的外壳蛋白基因呢?一个原因是人们发现转外壳蛋白基因的木瓜对病毒的抗性还不够强，另一个原因是出于对一种潜在风险的考虑。许多植物病毒可以由昆虫进行传播，番木瓜环斑病毒可由蚜虫传播。蚜虫在含有病毒的木瓜树上吸食汁液时，番木瓜环斑病毒通过外壳蛋白依附在蚜虫的刺针上，然后蚜虫再去吸食下一棵木瓜，就把病毒传过去了。
有些植物病毒由于其外壳蛋白不能跟蚜虫的刺针结合，因此没有蚜传特性。科学家们担心，如果转外壳蛋白基因的木瓜植株里恰好有另一种不具有蚜传性的病毒，那么后者的核酸会不会被番木瓜环斑病毒的外壳蛋白包裹起来，从而变成一种可以被蚜虫传播的、更容易流行的"新"病毒呢?因此，如果转入的不是外壳蛋白基因，而是病毒别的基因，显然就能避免这种潜在的"张冠李戴"可能。
值得指出的是，目前人们从没发现转外壳蛋白基因导致植物病毒的"张冠李戴"真正发生过。这也说明科学家们对转基因作物的研发是非常谨慎的，他们会事先考虑各种可能的不良后果，并加以避免。