为防止
蛋白质变性，在分离纯化蛋白质的操作中应该注意的几项一般有：
1，低温
温度是造成蛋白质变性的主要原因之一，在较高的温度下，绝大多数蛋白质较难保证结构的稳定。一般采取的操作是冰浴或者在层析冷柜中进行实验。
2，合适的pH
pH的剧烈变化，或者极高极低的环境
pH值容易总成蛋白质变性。在分离纯化时，因为不同层析柱的需求，可能会需要调节pH。使用较低浓度的盐酸或者
氢氧化钠调节pH有助于保持蛋白的稳定性。
3，合适的盐浓度
不同蛋白质的亲
疏水性不同，在不同的盐浓度下有各自的稳定窗口，这个很难预测，一般只能通过预实验确定蛋白的稳定盐浓度才能避免在分离纯化时大量变性。
4，避免剧烈的搅拌或者晃动
因为剪切力对蛋白质的结构可能会造成破坏，所以在混匀蛋白溶液时需要尽可能的动作轻柔。而将蛋白溶液加入其它溶液时也需要贴壁倾倒，不要剧烈操作造成蛋白溶液起泡变性。