在筹划建设国家实物地质资料馆专家论证时指出，国家所收藏的实物地质资料应在全国范围内具有典型性、代表性、特殊性、系统性——这是国家实物地质资料馆藏品定位的总原则。
代表性和典型性主要是指：代表地质科学理论与重要学说观点的典型实物地质资料；反映不同区域地质条件与重大地质现象或地质事件的代表性实物地质资料；反映地质调查、科学研究等重大工作成果和重要发现的代表性实物地质资料。特殊性是指：在国内外罕见的地质现象、地质作用、成矿类型、环境标志的代表性实物地质资料。系统性是指：馆藏实物资料的来源和所代表的方面包括不同地质时期、不同地区或空间、不同学科、不同地质工作类型，或统一部署的各类地质工作所产生的实物地质资料，如青藏高原1∶25万区调项目、不同矿种和不同成矿区带的系列矿床、“金钉子”剖面与建阶地层剖面实物地质资料等。
国家实物地质资料馆收藏定位如下：
1）国家实物地质资料馆馆藏实物地质资料是重要的地质档案，应具有长期保存的价值；
2）国家实物地质资料馆馆藏实物地质资料是国家巨大投入取得的宝贵信息资源，应具有重要开发利用价值；
3）国家实物地质资料馆所保存的实物地质资料要成系统，具有典型性、代表性和特殊性，要能够反映我国重要的地质勘查成果和地质研究水平；
4）国家实物地质资料馆要面向全国，所收藏的实物地质资料要类型齐全，重点突出；
5）国家公益性地质工作所形成的实物地质资料是馆藏的主要来源，对商业地质工作中产生的特别重要的实物地质资料可作少量收藏；
6）所收藏的实物类型以岩矿心、标本为主，少量样品副样及化探副样。