中药指纹图谱技术在全球范围内已经崭露头角，成为中药质量控制的主流趋势。美国FDA认可其在草药保健品申报资料中的应用，WHO在1996年的草药评价原则中也强调，对于活性成分不明的草药，指纹图谱可以作为产品质量一致性的证明。欧共体同样将其应用于植物药质量监控。中国科研机构如广州市药品检验所、北京大学、沈阳药科大学等，已经深入研究并实践了这项技术。
指纹图谱技术巧妙地结合了中医的整体观念，无需详细解析药物成分，只需关注关键指标性组分，通过比较和非指标成分的比对，实现中药质量的综合评价。它与中药现代化质量标准体系紧密相连，是解决药品质量控制问题的重要手段，对于中药新药研发具有革新意义，可以从多靶点角度理解药物作用。
这项技术涉及到信息获取、处理和挖掘，通过现代分离分析科学，获取中药的化学指纹图谱，结合药效研究和鉴定，形成药效组分指纹图谱。在中药材、复方制剂质量控制和创新药物研究中，指纹图谱技术解决了中药质量评价的关键问题，对于推动中药产业标准化、保证产品质量和可持续发展具有决定性影响。
与GAP基地建设和SOP质量管理紧密相连，中药指纹图谱技术对于保证中药的安全、有效和质量可控，保护物种和遗传基因稳定性，以及中药品种的地道性和药用价值，都发挥着至关重要的作用，是中药现代化建设不可或缺的技术支持。
中药指纹图谱是指某些中药材或中药制剂经适当处理后，采用一定的分析手段，得到的能够标示其化学特征的色谱图或光谱图。 中药指纹图谱是一种综合的，可量化的鉴定手段，它是建立在中药化学成分系统研究的基础上，主要用于评价中药材以及中药制剂半成品质量的真实性、优良性和稳定性。“整体性”和“模糊性”为其显著特点。