苹小食心虫在苹果树上1年发生2代，以老熟幼虫在枝干、根颈部的粗皮缝隙处和剪锯口四周死皮裂缝内以及吊枝绳、果筐等处结茧越冬。越冬幼虫于次年5月间开始化蛹，蛹期20 d左右，6月上、中旬出现越冬代成虫。成虫羽化后1～3 d开始交尾产卵，每雌产卵45粒左右，卵期1周左右。幼虫孵化后在果内危害约经18～30 d后，最早在7月上、中旬脱果；大部分于7月下旬至8月上旬脱果化蛹。再经半月左右的蛹期后，羽化为第1代成虫。第2代卵初期为7月下旬，盛期在8月上旬至8月下旬，卵期为．3～5 d，在果内危害20余天后老熟脱果。脱果盛期在9月上、中旬，幼虫脱果后即爬至越冬场所结茧越冬。山东半岛发生危害要提前一旬左右。
苹小食心虫在梨树上1年发生1代；只有少数可发生2代。越冬幼虫于6月下旬至7月上旬化蛹，盛期在7月上、中旬。蛹期在温度25℃的条件下为13 d左右。成虫发生初期为7月上旬，盛期在7月中、下旬。卵期5 d左右，幼虫在果内危害32 d左右后老熟，于8月上旬开始脱果，盛期在9月上、中旬。
老熟幼虫在树体上越冬虫数的多少与果实成熟期和采收期的早晚有关，成熟愈晚的品种，其越冬虫数越多；成熟愈早的品种，越冬虫数越少，有的甚至没有越冬幼虫，如红魁、黄魁等品种。老熟幼虫在树体上的越冬部位与树龄有关，在大树、老龄树上，越冬幼虫多在树体上部枝条的剪锯口，梨潜皮蛾幼虫危害的爆皮下(约占63.5%～85.7%)越冬；在龄期小、小树上，多在树体下部主干的老翘皮下(约占90%以上)越冬。因此，刮树皮防治越冬幼虫时，应根据品种和树龄确定防治目标，这样可节省劳力和提高除虫的效果。
成虫昼伏夜出，黄昏活动较盛，对苹果醋、糖蜜、糖醋液、茴香油和黄樟油均有趋性，但趋光性不强。成虫喜将卵散产在光滑的果面上，大多卵均落在果实的胴部，萼洼、梗洼处卵很少。因此，在施用杀卵药剂时，应重点放在果面上。在梨树上，成虫卵主要产在果实上，少数产在叶片上。
初孵幼虫在果面卵壳附近爬行20分钟左右后，咬破并蚕食果皮，约近lh后，开始在适当的部位蛀入果内，幼虫在果内历期因种而异。据研究观察，在红玉果实中为20.9 d，在国光内为28.9 d。幼虫向四周扩展，很少深入果心。在梨树上，苹小食心虫幼虫蛀果期因品种不同而异；最早是酥梨和鸭梨，7月上旬开始，蛀果率约7%，7月下旬蛀果率约31%；其次为红梨、约比酥梨，鸭梨迟一旬左右，8月上旬蛀果率约37%；当晚期花盖梨(约8月中旬)蛀果率为28%时，酥梨、鸭梨、秋白梨蛀果率已均达71%。因此梨树上进行虫情调查及预测方法和药剂防治时，不能单纯依靠卵果率作为防治指标，还应根据不同品种的蛀果期，分别进行测报与防治。
