你好，中山大学的这两个专业实力差不多，只是微电子属于物理科学与工程技术学院，偏重于电路系统与设计这方面；而电子信息科学与技术属于信息科学与技术学院，侧重于计算机与通信这方面。就业情况两者也没有多大差别，都算是近几年的比较热门的工科专业。不过女生学这个的确有点累，你要做好思想准备。
还有就是不知道你是高考生还是考研生？如果是高考生的话，这两个专业都是合作办学专业，微电子学（与香港理工大学合作办学），电子信息科学与技术
（与香港中文大学合作办学）。本科阶段就读这两个专业前两年在中山大学，后两年到香港的大学学习，并且学费是30000元/年，到了香港那边更贵。这个你要注意了。
参考资料：中山大学招生