南京的医学院校有：
1. 南京医科大学
2. 东南大学医学院
3. 南京中医药大学
以下是详细的解释：
南京医科大学是江苏省的一所医学类公办高校，创建于上世纪三十年代。该学校是江苏省人民政府与中国国家卫生健康委员会共建的专业特色高校，是知名的医学研究中心之一。其专业设置涵盖了临床医学、护理学、药学等多个领域。东南大学医学院是东南大学的下属学院之一，具有强大的医学教育和科研实力。医学院涵盖了临床医学、生物医学等多个学科领域，培养了大批优秀的医学人才。南京中医药大学是一所以中医药为特色的多学科研究型大学，是江苏省人民政府与国家中医药管理局共建的高等学府。学校历史悠久，专业设置全面，涵盖了中药学、针灸推拿学等领域。这三所医学院校在南京乃至全国都享有较高的声誉和影响力。