脑脊液检查中的酶学测定通常包含了转氨酶(ALT、AST)、乳酸脱氢酶(LDH)和磷酸肌酸激酶(CPK)的检测。ALT和AST的脑脊液活性大约为血清酶活性的一半，LDH则约为血清酶活性的十分之一，而CPK在脑脊液中的活性通常低于血清。这些酶的异常升高有特定的临床意义：ALT和AST的增高可能提示脑梗塞、脑萎缩、颅脑损伤或中枢神经系统疾病；LDH活性增加则可能与脑组织坏死相关，如细菌性脑膜炎、脑血管病和脑瘤；CPK异常则可能与化脓性脑膜炎、癫痫、多发性硬化症等多种情况有关。
脑脊液免疫球蛋白测定则是检查IgG、IgA、IgM和IgE的水平。正常参考值分别为IgG 10-40mg/L，IgA 0-6mg/L，IgM 0-13mg/L，IgE极少量。在临床中，IgG的增高常见于神经梅毒、化脓性脑膜炎、结核性脑膜炎等；IgA的增高可能与上述疾病以及肿瘤相关；IgM的异常可能与化脓性脑膜炎、病毒性脑膜炎、肿瘤和多发性硬化症相连；而IgE的增多则提示可能存在脑寄生虫病等感染情况。
脑脊液检查（examination of cerebrospinal fluid）。穿刺后测得的脑脊液压力，侧卧位成人为0.78-1.96kPa(80-200mm水柱)，婴儿有为儿童为0.39-0.98kPa(40-100mm水柱)，新生儿为0.098-0.14kPa(10—14mm水柱)。 观测初压时应注意脑脊液液面有无呼吸性搏动（随呼吸产生0.098-0.197kPa(10-20mm水柱的液面搏动)和脉搏性搏动（随脉搏产生0.02-0.039kPa(2-4mm水柱的液面搏动）。前者消失时，提示椎管内有梗阻或有枕大孔疝，均宜小心。