违法的！企业通过微信发工资是不合法的，当企业与员工两方发生劳动仲裁争议的时候，通过微信形式发放工资的形式很难取证，也无法得到法律仲裁的承认，况且在大多数的情况下微信发工资一般都是由企业老板或财务的私人微信账号直接转账至员工微信账号，这些转账的钱没用通过公司的对公银行账号转账，所以就企业来说存在较高的风险。
主要原因如下：
1、目前国家对企业的社保和地税是实行联网管理，假如老板用个人微信来转账发工资，就没法在国家系统里留下记录，相当于是逃避了社保缴纳和个人纳税的义务；
2、国家关于劳动法和工资支付的问题，也不允许使用微信支付，那一定是要通过正规的对公账户来向员工支付工资，并且代缴社保和个税等费用。
公司发工资原则上应该通过银行账户发放，微信发存在偷税漏税的嫌疑，可以去税务部门举报。数额较大的话，构成刑事犯罪，会对直接负责人人员或主管人员处以刑罚，对单位处以罚金。
企业以什么方式支付工资
1、工资应当以货币形式支付，不得以实物或有价证券代替货币支付;
2、企业应将工资直接支付给劳动者本人，劳动者本人因故不能领取工资时，也可以由劳动者授权的亲属代为领取，但应当有委托证明。
3、企业应及时支付工资。
企业必须在与劳动者约定的日期支付工资，并且至少每月支付一次工资。如果工资按年结算，则应按月预付，到期结算。实行周、日、小时工资制的，可以按周、日、小时支付工资。对完成一次性临时劳动或某项具体工作的劳动者，企业应按照约定在其完成劳动任务后即期支付工资。工资如果按月支付，必须确定支付日期。如遇法定假日或休息日，通过银行发放工资的不得推迟支付工资，直接发放工资的，应提前支付工资。对实行年薪制或按考核周期支付工资的劳动者，企业应当每月按不低于当地最低工资的标准预付工资，年终或考核期满时结算。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》
第十七条 【劳动合同的内容】劳动合同应当具备以下条款：
（一）用人单位的名称、住所和法定代表人或者主要负责人；
（二）劳动者的姓名、住址和居民身份证或者其他有效身份证件号码；
（三）劳动合同期限；
（四）工作内容和工作地点；
（五）工作时间和休息休假；
（六）劳动报酬；
（七）社会保险；
（八）劳动保护、劳动条件和职业危害防护；
（九）法律、法规规定应当纳入劳动合同的其他事项。劳动合同除前款规定的必备条款外，用人单位与劳动者可以约定试用期、培训、保守秘密、补充保险和福利待遇等其他事项。
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