商铺卖100万要缴纳买卖合同差价的5.65%营业税及附加，分为不同的档次计算：小于等于50%，税率为30%；大于50%小于等于100%，税率为40%；大于100%小于等于200%，税率为50%；大于200%，税率60%。
同时在扣除了营业税和土地增值税后，剩余的净利润再按照20%征收所得税，具体税种为：
1、个人所得税：(评估价-原价)*20%或评估价*3%。
2、营业税：(评估价-原价)*5.5%或评估价*5.5%。
3、土地增值税：(评估价-原价)*30%至60%或评估价*30%至60%。
扩展资料：
卖家出售的时候，商铺不论年限，都要交纳以下几种税费：
房地产交易手续费3元/平方米。
印花税：房屋产价的0.05%。
同时，商铺达到交付使用条件后，出卖人应当书面通知买受人办理交付手续。双方进行验收交接时，出卖人应当出示本合同第九条规定的证明文件，并签署房屋交接单。
参考资料来源：百度百科-商铺买卖合同
参考资料来源：百度百科-商铺买卖税费
一、卖家出售的时候，商铺不论年限，都要交纳以下几种税费：
（一）房地产交易手续费3元/平方米。
（二）印花税：房屋产价的0.05%。
（三）土地增值税：
1、可提供上手购房发票的，土地增值税=[转让收入－上手发票价（每年加计5%）－有关税金]×适用税率。
2、不能提供上手购房发票的，土地增值税=（转让收入－转让收入×90%）×30%。
（四）个人所得税：
据实征收为（转让收入-房产原值-合理费用）×20%，核定征收为转让收入×7.5%×20%。
转让收入-房产原值-合理费用相当于个人净收入。
（五）增值税
自2016年5月1日起，在全国范围内全面推开营业税改征增值税试点，建筑业、房地产业、金融业、生活服务业等全部营业税纳税人，纳入试点范围，由缴纳营业税改为缴纳增值税。《财政部国家税务总局关于全面推开营业税改证增值税试点的通知》（财税[2016]36号）
对于非一线城市，个人购买不足2年的住房对外销售，按照5%的征收率全额缴纳增值税；个人将购买2年以上（含2年）的住房对外销售的，免征增值税。
北、上、广、深四个一线城市，个人购买不足2年的住房对外销售的，按照5%的征收率全额缴纳增值税；个人将购买2年以上（含2年）的非普通住房对外销售的，以销售收入减去购买住房价款后的差额按照5%的征收率缴纳增值税；个人将购买2年以上（含2年）的普通住房对外销售的，免征增值税。
（六）土地出让金：
商业用途用房，按其网格点基准地价的35%计收；
商业路线价区段路的商业临街宗地，加收路线价的10%；
办公用途用房按其网格点基准地价的30%计收。
（七）土地出让金契税：
按本次征收土地出让金价款的3%征收。
扩展资料
商铺买卖注意事项
一、商铺内外有别：商铺分为沿街式的外街式商铺还有商城内内街式商铺，根据地段选择相应的商铺。
二、商铺产权明晰：买商铺要通过相关部门了解商铺的产权是否符合国家政策，购置二手商铺了解清楚该商铺的房屋产权证、土地证、抵押或质押状况的权属证明等，以免引起产权纠纷。
三、考虑商铺地段：经常去想买的店铺转转，了解人流量，在选择是否下手，地段的选择也是很重要的。
四、考虑投资回报率：对于开发商宣称的租金收益以及投资回报率，大家一定要去实地考察，且在计算商铺的投资收益时，一定要充分考虑在商铺的前期购买环节中的支出。
五、考虑商铺面积：60㎡左右及130~150㎡两种面积区间的商铺比较容易出租，且对投资者的资金压力也不会太大。
参考资料来源：百度百科-商铺买卖税费
参考资料来源：百度百科-营业税改征增值税试点有关事项的规定
商铺和办公楼都属于商业地产，投资商铺，与你有多少住宅无关。贷款方面，首付至少五成，利率是同期商业贷款基准利率的1.1倍，贷款年限最长10年。贷款的资格与你的住宅贷款记录无关。需要提醒的是，你目前住宅月供加上商铺月供，合计不宜超过你每月可支配收入的一半。
在商铺税收方面，买入较简单，主要是买入合同金额的3%契税和0.05%的合同印花税。如果是买二手商铺的话，下家还需缴纳0.5%的交易手续费。
卖出的税收计算比较复杂。首先，是买卖合同差价的5.65%营业税及附加。第二，是土地增值税。按照买卖差价与原买入价计算得到利润率，分为不同的档次计算：小于等于50%，税率为30%；大于50%小于等于100%，税率为40%；大于100%小于等于200%，税率为50%；大于200%，税率60%。在扣除了营业税和土地增值税后，剩余的净利润再按照20%征收所得税。一般业内估计商业地产卖出税收时，以买卖差价的40%左右计算，误差不大。
至于商铺选择的注意因素，需要一定的投资眼光，具体项目要具体分析。从合同风险上来说，投资者首先要注意项目产权年限，商铺产权最长不超过50年，但如果开发商或者上家持有的时间较长，那就会减少你所拥有的物业产权年限。
关于包租，法律上是不允许开发商直接包租的，但目前大多是由商场运营企业 （有些是由开发商另外注册的经营管理公司）与业主签订长期租赁合同，这是合法的。最长租赁期限不超过20年。
此外，还要注意商铺是否有上下水和燃气管道，如果没有燃气管道，餐饮租户则无法经营。本回答被网友采纳