1953年,为迎接中越两国通航,机场的设施需要改善,位于古城路6号的位置修建了975平方米的候机室(平房),包括贵宾室、联检厅、餐厅等,具备旅客办理手续、候机、提取行李等基本功能。
1958年,南宁筹备新建吴圩机场。4年后,南宁吴圩机场投入使用。当时的机场规模为民航二级机场,起降伊尔-18型及以下各类民航机型和空军米格-19型;跑道长2400米,宽60米。候机楼为三层建筑,建筑面积3405平方米,可同时容纳和满足300多名旅客候机、休息的需要。这个航站楼在上世纪80年代进行了一次扩建,后来用做货运楼,建筑仍保留着。当时机场只有3条国内航线,分别是飞昆明、广州、北京的,还有一条飞越南河内的国际航线,一周13个航班,平均每天还不到2个航班,一年的旅客吞吐量不到10万人次。
1989年5月,南宁吴圩机场停航进行场道盖被施工,在原有的跑道、联络道、站坪的面积上加盖混凝土,并将跑道向南延长300米至2700米。同时完善了跑道助航灯光等配套设施,提高了机场起降标准,可保障MD-82以下各型飞机的起降。1990年8月复航后,机场逐步开辟了新航线,航班由每周十多班上升到每周六七十班。
2002年南宁机场旅客吞吐量首次突破百万人次,之后便进入了发展的“快车道”:2006年突破200万人次、2008年突破300万人次,这座在当时建设得很有前瞻性的候机楼,在十年的时间里便达到了饱和。
之后每年,南宁机场的旅客吞吐量均以两位数的速度递增,到2013年,旅客吞吐量突破800万人次,是原有设计能力的3倍多。这个“90后”机场已经疲态尽显,不堪重负。
2010年,经过反复评估、论证,南宁机场扩建工程获国家发展改革委批准立项。总建筑面积18.9万平方米的T2航站楼投入建设。