清代地方官制大致与明代相同，只存在着细微差距。
明代，为避免地方权力过于集中，继而威胁中央，朱元璋废“行中书省”制，改行“三司分设”制，设承宣布政使司、提刑按察使司、都指挥使司三司，承宣布政使司掌全省行政事务；提刑按察使司掌全省司法监察事务；都指挥使司掌全省军事事务。三司最高长官分别是布政使（设左、右布政使）、按察使、都指挥使。
这就是布政使、按察使的由来。
布政使归中央六部统管，按察使归刑部、都察院统管，都指挥使归兵部、五军都督府统管，三者互不统属，谁也节制不了谁，谁也管不了谁，直接听命于中央。
如果本省发生重大事件，由布政使、按察使和都指挥使共同商议，若达不成共识，则上报中央处理，由内阁、六部共同商议，后交由皇帝做最终决定。
明中期后，由于官僚政治日益腐败，三司长官之间相互扯皮、相互掣肘，致使地方政令不通，日渐混乱。地方乱，则中央不稳，对于地方经济建设、赋税征收、灾民抚恤等等都需要地方长官的配合，地方长官不配合，中央对地方的政策，就很难实施下去。
地方若治理不好，则天下势必会大乱。
故而，明廷不得不经常性临时派出尚书、侍郎、都御史等京官去地方充任总督、巡抚等职，节制三司，或至地方安抚军民，或主管兵事，事情办完了，即回京交差。后来，由于明朝地方越来越混乱，南方盗起，北寇犯边，往地方派巡抚渐为常态，各省均设巡抚衙门，有权节制三司，总一省军政事务，成为地方政府实际首脑。
这就是总督、巡抚的由来。
清取代明后，清朝统治者将明代的地方机构和官制更加完善，使之更好地维护对地方的统治，故而明清地方上的机构和官职有了些许的变化，最明显的区别就在于明代的总督并非是地方正式军政长官，因事而设，事毕即撤，但是到清代却成为了地方最高军政长官，总管一省或二三省。除此，明代的总督出镇地方，所辖之事多是军务或粮饷，多不会涉及到民政，清代总督却是军政一把手抓，即可节制本省军事长官提督，也可节制本身民政长官巡抚，权力相对明代总督，却是要大上许多。
除此，布政使一职明清也有些许区别，在明代巡抚未成地方军政长官时，布政使权力极大，掌本省政务，直属于中央，地方无人可制衡，故而朱元璋在设布政使时，为防止布政使脱离中央的控制，便设左、右布政使，两位布政使同掌本省事，地位相等，相互制衡。此后，巡抚虽然出现，然左、右布政使却并未废除，两人依旧是承宣布政使司的共同主官。
到了清代，由于布政使已经成为巡抚的属官，且还有总督节制，故而自康熙后，除江苏设江宁、苏州两布政使外，其余各省皆只置一位布政使。
此外，在地方上，清朝还设置了一个明朝所没有的官职，那就是驻防将军。
清朝作为少数民族，其统治者能够入主中原，运气占据多数，要不是中原内乱、不团结，凭仅有十几万的满洲八旗，清朝想入主有百万大军的中原，这几乎是不可能的。因此，之后清朝虽入主中原，但其统治者却也是如履薄冰，胆战心惊的，为牢牢掌控住中原，清朝是想尽办法，其中一个办法就是派遣满洲八旗分驻各省要地，控制住全国重要地区、交通要道和险要地区。
当时，这些驻扎在京城之外的满洲八旗军，其最高军事长官就是驻防将军。清廷在全国共设驻防将军十四人，分别驻守盛京、吉林、黑龙江、绥远城、江宁、福州、杭州、荆州、西安、宁夏、伊犁、成都、广州、乌里雅苏台，分别冠以所在地名如盛京将军、吉林将军等。
说完明清地方官制的区别，再具体说说他们是干嘛的。
清代省一级的最高军政长官就是总督。有清一代，共设九位总督，分掌各省：东三省总督（辖奉天、吉林和黑龙江）、直隶总督（辖直隶）、两江总督（辖江苏、安徽和江西）、四川总督（辖四川）、闽浙总督（辖福建、浙江和台湾）、云贵总督（辖云南、贵州）、湖广总督（辖湖北、湖南）、两广总督（辖广东、广西）和陕甘总督（辖陕西、甘肃和伊犁）。
总督位在巡抚之上，为便于其管辖所属各省，清代总督多会加兵部尚书、都察院右都御史衔，从而名正言顺执掌本省军政事务。可节制自巡抚之下所辖各省所有官员，包括巡抚、布政使、按察使、提督、道台、知府等，一切所辖各省事务，如军务、政务、税务、粮饷、刑狱、科举等等，总督皆有权管辖。
若要问总督是现在什么职务，类似于新中国成立初期东北区、华北区、华东区、中南区、西北区、西南区等六大行政区的第一书记。
总督之下就是巡抚。同总督一样，巡抚也会加兵部侍郎、都察院右副都御史衔，从而执掌本省军政事务，及节制本省所属官员。一切本省事务，诸如军务、政务、税务等等，巡抚皆有权管辖。
除此，总督虽位在巡抚之上，然而巡抚却不是总督的属官，他们并不是上下级关系，两人都直属于中央，总督可节制巡抚，巡抚亦可制衡总督，两人都有监察、弹劾之权。遇到本省有重大事件，需由督抚两人共同商议，达成共识后，方可实施，若达不成共识，则上报中央。
若要问巡抚是现在什么职务，类似于现在的省委书记。
巡抚之下就是布政使。布政使协助巡抚执掌本省赋税、徭役、科举等民政事务，同时“帅府、州、县官，廉其录职能否，上下其考，报督、抚上达吏部”，并负责考察本省官吏廉政与否，勤政与否，上报督抚。
若要问布政使是现在什么职务，类似于现在的省长。
按察使位在巡抚、布政使之下。按察使为一省司法长官，掌一省刑名按劾，负责本省司法监察邮驿诸事，同时“三年大比充监试官，大计充考察官，秋审充主稿官” ，乡试充任监试官，三年大计（考核地方官政绩）充任考察官，秋审充任主稿官。
若要问按察使是现在什么职务，类似于现在的省法院院长、省司法厅厅长、省检察院院长兼省公安厅厅长。
盛京将军，是统辖奉天的最高军政长官，执掌奉天地区的所有军政事务，包括民政、军政、财政等事务。
光绪三十四年（1908年）前，作为清朝的龙兴之地东三省并未设省，故而没有巡抚、总督一说，当时东三省的最高军政长官就是驻防将军，其中奉天地区的就是由盛京将军执掌，是为最高军政长官。
若要问盛京将军是现在什么职务，类似于现在的省委书记。