第一步：点击进入官方网站：深圳市公安局出入境便民网，点击左上角“网上预受理”。
深圳港澳通行证网上官方预受理网址：
http://www.sz3e.com/第二步：选择办理业务种类，个人网上预约，点击第一项。
第三步：选择个人身份类型。
第四步：即按照个人需要申办的证件类型，选择申请的证件。下文仅截取非深圳户籍居民的申请步骤，深圳户籍与非广东籍居民申请页面类似。
第五步：点击接受“居民普通护照申请协议书”。
非深圳市户籍居民往来港澳地区申请协议书一、非深圳市户籍人员在深申请出入境证件的适用对象为：
1. 在本市连续一年以上(截至上月)缴纳社会保险的非本市户籍就业人员;
2. 在本市高等院校在读的全日制非本市户籍大学生;
3. 第1、2类人员的配偶及未满16周岁的子女且在深圳连续居住6个月(含)以上;
4. 本市户籍人员的非本市户籍的配偶、未满16周岁的子女;
5. 60周岁(含)以上老人;
6. 居住6个月(含)以上的非本市户籍居民。
上述6类人员均不含登记备案国家工作人员。其中，第3-5类人员只可办理护照、大陆居民往来台湾通行证及签注;
第6类人员只可办理换发、补发(含过期重领)护照、大陆居民往来台湾通行证以及申请赴台同类签注。
二、被告知不予签发出入境证件的申请人，依法享有在户籍所在地申请行政复议或者提起行政诉讼的权利。
三、申请人须如实填写个人资料并确认填写内容是否正确。如资料不实的，将不予受理。
四、申请人每预约申请一次，只能办理一本证件(含签注)。如同时申办二本以上证件(含签注)，请分别预约申请，成功取得受理
号后方能受理。
五、申请人必须如实、正确填写申请资料，对于弄虚作假骗领出入境证件的申请人，公安机关将依法依规处理。
六、同一公民不得同时持有两本以上(含两本)同类型有效出入境证件(含签注)。
七、申请人所申请签注的有效期不能超过往来港澳通行证有效期，同时要预留30天的办证时间;否则，公安部门不予受理。
例如：您申请1年有效的香港签注，请确保您所持有的通行证有效期在1年零30天以上。
八、为更好统筹安排办证工作，预约号过期作废。如因故未能按照预约时间办理，或需更改预约时间或地点的，请取消之前已成功预
约的申请号后重新预约。如果忘记申请密码，请凭本人身份证到您预约的所在公安局出入境科查询、取消。
九、如您已预约成功但未在预约的时间段内去预约点办理，请在预约的时间段之前将预约取消，如果此种情况超过3次，您将被列入黑
名单，将不能再进行网上预约申请(备注：请点击首页的“查询/取消/补打表格”按钮进行取消)
第六步：正确填写自己的身份证号码与中文名字。
第七步：选择出境事由、前往地、申请类别、受理单位与预约时间。
第八步：完整填写《非深圳市户籍居民往来港澳地区填写申请信息》。
备注：这个信息是到现场申请时在受理处需要打印确认的。确认后拿着这份信息到柜台办理相关业务。