新疆天文台面对新的发展机遇,充分发挥新疆观测环境和地域优势,面向国际天文学研究前沿和国家战略需求,进一步完善体制机制,不断凝练科学目标,合理规划学科布局,在研究方面走出了一条发挥自己独特优势的开拓创新之路,形成了具有自己特色的研究团队,研究工作取得了具有国际前沿水平的研究成果,并在相关领域取得了一定突破,实现了观测能力和研究课题的跨越式发展。
目前,新疆天文台南山基地是国际上重要的VLBI站点,是国内重要的脉冲星观测研究、厘米波分子谱线观测研究和活动星系核观测研究基地,也是我国探月工程中VLBI测轨系统的四个站点之一;新疆天文台空间目标与碎片观测组是中国科学院空间目标与碎片观测研究中心成员;新疆天文台射电天体物理实验室是中科院射电天文重点实验室成员,也是新疆维吾尔自治区的重点实验室。“新疆大学-国家天文台联合天体物理中心”在区域天文人才培养方面起着重要的作用。