食品加工小作坊需要办理的证件：
1、工商营业执照：到所在地工商行政管理局（所）办理工商营业执照。
2、健康证：到所在地疾病预防控制中心体检并办理健康证。
3、食品流通许可证：需带上身份证及复印件、健康证、房屋产权证（或租房合同）等资料到所在地食品药品监督管理局（所）办理食品流通许可证。
4、食品生产加工小作坊许可证：到所在地食品药品监督管理部门申请登记办理。
【法律依据】
《中华人民共和国工业产品生产许可证管理条例 》第九条企业取得生产许可证，应当符合下列条件：
（一）有营业执照；
（二）有与所生产产品相适应的专业技术人员；
（三）有与所生产产品相适应的生产条件和检验检疫手段；
（四）有与所生产产品相适应的技术文件和工艺文件；
（五）有健全有效的质量管理制度和责任制度；
（六）产品符合有关国家标准、行业标准以及保障人体健康和人身、财产安全的要求；
（七）符合国家产业政策的规定，不存在国家明令淘汰和禁止投资建设的落后工艺、高耗能、污染环境、浪费资源的情况。
法律、行政法规有其他规定的，还应当符合其规定。