在新车上牌照的流程中，至关重要的一项是将车辆的合格证原件交付给车管所，这是为了进行妥善保管。车管所的主要职责之一，便是负责机动车的各类登记手续，包括：
机动车注册：这是新车初次上路的必备程序，通过车管所的登记，车辆才能合法行驶在道路上。
变更登记：当车辆的某些信息需要变更，如车主姓名、车辆颜色等，也需要在车管所进行相关手续的办理。
转移登记：当车辆发生所有权转移，如买卖或赠予，车管所会负责更新车辆所有权和行驶证信息。
抵押登记：如果车辆被用于贷款或担保，车管所会记录这一信息，以保障各方权益。
注销登记：当车辆不再使用或报废，车管所会进行注销手续，确保车辆信息从官方记录中剔除。
因此，可以说，车辆的合格证原件确实是由车管所负责保管的，这是其履行其职能不可或缺的一部分。