（1）磺胺类。40 年代开始用磺胺药治疗本病，其中以水杨酸偶氮磺胺吡啶（SASP）效果最佳。口服后易在肠内分解为磺胺吡啶及5- 氨基水杨酸，对结肠壁组织有亲和力，起到消炎作用。常用于轻、中型患者。始量为0.5g，每日4 次，口服。每隔2 ～ 3 天增加1g，直到获得疗效。每日总量3 ～ 6g，个别可达8g。病情稳定，维持量为每日1.5 ～ 2g，持续4 周以上，后隔3 ～ 5 日减量1 次，直到每天服用1 ～ 2g 为止，至少持续1 年。然后考虑停药，以降低复发率。
对停药后易复发者，可选最小剂量长期维持治疗。有效率在80% 以上。
其副作用常有恶心呕吐、头痛、全身不适。或引起白细胞减少、关节痛、皮疹、蛋白尿等。尤其是服用每日超过4g 以上者，副作用明显。其他如琥珀酰磺胺噻唑、肽酰磺胺噻唑及复方新诺明等也可选用。
（2）抗生素。尤对急性暴发型及中毒作结肠扩张者采用抗生素治疗，用前应做细菌培养。如青霉素类、氯霉素、克林霉素、妥布霉素、新型头孢霉素和先锋霉素均可酌情选用。不宜口服以避免胃肠道刺激症状。
（3）甲硝唑。每日1200mg，分3 ～ 4 次口服，3 ～ 6 个月为一疗程，目前尚未有严重副作用的报道。病程越短疗效越佳，病程在一年以上者，有效率在60% ～ 70%。
（4）激素治疗。包括糖皮质和促肾上腺皮质激素。本类药物能抑制炎症和免疫反应，缓解毒性症状，近期疗效较好，有效率达90%。另外激素可增加食欲，改善患者情绪。如小剂量泼尼松15mg，可明显减少复发率。并发腹膜炎或腹腔内脓肿形成者不宜应用。
① 口服皮质激素。病情活动期且病变广泛者， 泼尼松每日40 ～ 60mg， 分3 ～ 4 次口服。病情稳定逐渐减量， 每日10 ～ 15mg，持续半年后停药。在减量过程中或停药后，给以柳酸偶氮磺胺吡啶，以防停药后或减量过程中病情复发。
②局部给药。病变只限于乙状结肠直肠者，可选：含氢化可的松10mg 的肛门栓剂， 每日2 ～ 3 次； 琥珀酸氢化可的松50 ～ 100mg 或泼尼松龙20 ～ 40mg 溶于50 ～ 100ml 液体中，每日1 ～ 2 次，保留灌肠，同时加用SASP 及适量的普鲁卡因或中药煎剂，10 ～ 15 天为一疗程。灌肠后嘱患者平卧位或俯卧位，左、右、侧位等各15 ～ 20 分钟，以利药后均匀分布黏膜面上。
③静脉用药。如暴发型、严重活动型及口服无效者多采用。氢化可的松200 ～ 300mg 或半琥珀酸钠氢化可的松200 ～ 300mg，或α-1- 磷酸泼尼松龙40 ～ 60mg，10 ～ 14 天为一疗程。病情稳定后改口服剂，每日口服泼尼松60mg。
（5）免疫抑制剂。适用于病情较重，病变范围较广者。考虑选用硫唑嘌呤，6-mp、CTX 等。6- 巯基嘌呤1.5mg/kg，分次口服；硫唑嘌呤每日1.5 ～ 2.5mg/kg，分次口服，疗程约1 年。其疗效至今不明确，本类药物毒性大，副作用多，尤其对骨髓造血功能影响大，在用药中应定期复查骨髓象。