ISO9001的程序文件主要包括： 质量手册、程序文件以及作业指导书。
质量手册是描述质量管理体系的整体结构、过程、方针和目标等内容的文件。它提供了一个组织的质管理框架，对于组织内部管理和外部沟通都至关重要。质量手册是质量管理体系的核心文件，用以展示组织如何遵循ISO9001标准实施质量管理。
程序文件是对质量手册中各个过程的详细化描述和实施指南。这些文件详细说明了为实现质量管理体系有效运作所需的具体步骤和方法。程序文件涉及各个部门和职能领域，确保各项活动都按照既定的标准和程序进行。它们是基于质量手册的进一步展开，更具体地规定了工作职责、要求和记录。
作业指导书是一种支持性的工作文件，为员工提供实际操作层面的指导。这些文件详述了执行特定任务的具体步骤和方法，以确保员工能正确、一致地执行工作，从而达到质量管理体系的要求。作业指导书可能包括工艺流程、检验规程、设备操作指南等。
这些程序文件共同构成了ISO9001质量管理体系的基础，确保组织能够按照既定的标准和程序进行质量管理，从而提供高质量的产品和服务来满足客户的需求。