医院科长的职位低于主任。
解释如下：
在医院的管理层级中，主任通常是一个科室或部门的最高负责人，负责该科室的医疗、教学、科研以及行政管理等工作。他们通常具有高级的专业技术职务，如主任医师、主任药师等，对于科室的各项工作具有决策权和管理权。
科长则通常负责管理医院内部的某个科室的行政事务，如病房管理、物资采购等。他们是科室行政管理的中层干部，负责执行主任的决策，管理科室的日常运作。
因此，从职位层级上来看，医院主任的职位高于科长。主任负责更高层次的管理工作，拥有更大的决策权和管理范围，而科长则主要在主任的领导下，负责具体的行政管理工作。