区别在于所属机构不同。通常意义上单位指国有公司或者政府独立的行政机构；部门指构成公司的单元或行政机构内部的单元。
举例一：
中国核工业集团公司我们也可以称为单位，如我们说去公司上班或去单位上班。中国核工业集团人事部我们叫做部门。
举例二、
某市交通运输局可以称为单位，如我们说去单位上班或去局里上班。交通运输局下属的计划科我们称为部门。
拓展资料
组织内承担特定任务的机构不能叫部门，如生产车间、销售公司等，属于内部单位，即使有的组织名称叫做XX部，如销售部，如果其没有承担管理职能的话，也不属于部门。如fire department要翻译为消防局，而不能翻译为消防队，因为消防局是有管辖权的管理机关，消防队是作战单位。
参考资料 ：百度百科：部门
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